1938年7月中旬，譚震林在皖南繁昌中分村。

在尖銳復(fù)雜的斗爭環(huán)境中，譚震林非常重視從實際情況出復(fù)確定方針政策。原紅四軍四縱隊司令傅柏翠，后因種種原因脫離紅軍部隊，回鄉(xiāng)組織武裝，聽從敵人指揮。要怎樣對待這樣一支武裝？譚震林認(rèn)為，傅柏翠是生存在國共斗爭的間隙之中，如果失敗，也難以幸存。因此，可以同傅溝通聯(lián)系，建立一種微妙的關(guān)系。于是，譚震林給傅柏翠寫了一封信，說明“我要生存，你也要生存，我們不能生存，你們也要完蛋”的道理。這封信使傅認(rèn)識到這種利害關(guān)系，回信表示同意雙方互不侵犯。后來，傅柏翠的部隊果然同紅軍游擊隊安然相處，國民黨正規(guī)軍來搜山時，傅也不積極配合，只是虛張聲勢，敷衍了事。有時紅軍游擊隊還可以到傅的地方暫時隱蔽。有時他還幫助游擊隊買些糧食和藥品。在“左”傾路線統(tǒng)治時，不管青紅皂白，對替白軍做過事的都要?dú)ⅲY(jié)果使一些保甲長見到紅軍游擊隊的人就躲起來。譚震林感到這種情況對堅持斗爭不利，就親自到蘭田、大洋壩作調(diào)查。通過一個甲長，譚震林找到大洋壩的保長，問為什么見到紅軍要躲。這個保長回答說，現(xiàn)在我們處境很困難，白軍出布告說，通共產(chǎn)黨要?dú)?，紅軍看到我們應(yīng)付白軍，又說是叛徒也要?dú)?。我們不愿意?dāng)保長，百姓又不肯，村子里總得有個人出來當(dāng)，這叫我們怎么辦呢？譚震林認(rèn)為要改變保甲長這種困難處境，紅軍對保甲長的政策應(yīng)改變，應(yīng)把消滅保甲制度的政策改為利用保甲長的政策。他很快寫信給張鼎丞、鄧子恢，建議軍政委員會對此進(jìn)行討論。他們在雙髻山開會決定把利用保甲長政策規(guī)定下來，并提出“白皮紅心”的口號。后來，這種辦法對游擊隊的斗爭非常有利。

在敵人重兵對閩西根據(jù)地實行“圍剿”的情況下，譚震林指揮紅軍游擊隊廣泛開展游擊戰(zhàn)爭，并采取靈活機(jī)動的戰(zhàn)術(shù)。他經(jīng)常強(qiáng)調(diào)仗打不打，要看對當(dāng)?shù)厝罕娛欠裼欣?，對我軍是否有利，有利就打，無利就不打。他要求游擊隊平常住在山中的樹林里，在上午10點(diǎn)至下午4點(diǎn)敵人“清剿”較緊時就隱蔽起來，同敵人“捉迷藏”，其它時間就積極開展活動。在活動中可以集中，可以分散，可以聲東擊西，把消滅敵人和宣傳、瓦解、利用敵人巧妙地結(jié)合起來。有一次，他派部隊去拔掉公路上的一個敵軍地堡，打進(jìn)去后，不繳他們的武器，而是把敵軍的頭頭抓起來，向士兵們宣傳革命的道理，要他們不要替統(tǒng)治階級賣命，同游擊隊合作，有什么情況及時報告我們。結(jié)果，他們愿意同紅軍游擊隊合作，把敵人的堡壘變成為游擊隊可利用的堡壘。

1935年底，閩西南軍政委員會通過在上海的聯(lián)絡(luò)站與黨中央交通站取得了聯(lián)系，得到了黨中央“關(guān)于開展抗日反蔣統(tǒng)一戰(zhàn)線策略”的指示。1936年1月1日，閩西南軍政委員會在上杭雙髻山召開了第二次全體會議。譚震林被增補(bǔ)為軍政委員會副主席。會議討論了中共中央關(guān)于建立抗日反蔣民族統(tǒng)一戰(zhàn)線的指示，分析了當(dāng)時福建和閩西南地區(qū)的政治形勢，明確了在閩西南地區(qū)開展抗日反蔣統(tǒng)一戰(zhàn)線的新方針和新政策。

1937年三四月間，張鼎丞、鄧子恢、譚震林獲悉西安事變和西安事變和平解決的消息后，為適應(yīng)新形勢，決定派方方赴延安向黨中央?yún)R報請示工作。5月，閩南紅三團(tuán)轉(zhuǎn)來了南方工委給閩西南軍政委員會的信，得知黨中央抗日民族統(tǒng)一戰(zhàn)線的方針已由抗日反蔣轉(zhuǎn)為聯(lián)蔣抗日。張鼎丞、鄧子恢、譚震林立即在永定召開閩西南軍政委員會緊急會議。會議一致?lián)碜o(hù)中央的方針政策，提出了“愿與國民黨和平合作，共同抗日”的口號，部署新形勢下的工作。會后，以張、鄧、譚名義發(fā)表了致國民黨駐軍的公開信和致各界人士書，提出停止內(nèi)戰(zhàn)、共同抗日的主張。

7月，閩粵贛邊區(qū)臨時黨代會在上杭白砂召開。從延安回來的方方傳達(dá)了黨中央和毛澤東對閩西南黨堅持游擊戰(zhàn)的表揚(yáng)。毛澤東對方方說：“你回去問候張、鄧、譚各同志好，告訴他們，你們?nèi)甑目喽酚泻艽蟮墓??！庇终f：“你們堅持了三年游擊戰(zhàn)爭，保留了這么多的部隊和干部，保留了蘇區(qū)20萬人口地區(qū)的土地革命果實，保護(hù)了蘇區(qū)廣大群眾的利益，這是偉大的勝利。”會議根據(jù)中央指示，決定取消軍政委員會，閩西南特委與潮梅特委合并，成立閩粵贛邊省委，張鼎丞為省委書記，方方為組織部長，鄧子恢為宣傳部長，譚震林為軍事部長。

10月，黨中央就南方各省紅軍游擊隊改編成新四軍問題與國民黨政府達(dá)成協(xié)議。1938年1月6日，新四軍軍部移到南昌。15日，閩粵贛邊省委接到新四軍軍部指示，令譚震林到南昌接受命令，辦理部隊整編有關(guān)事宜。譚震林立即率警衛(wèi)人員日夜兼程奔赴南昌，辦理有關(guān)部隊整編集結(jié)事宜。根據(jù)新四軍司令部命令，堅持閩西游擊戰(zhàn)爭的2000多名紅軍游擊隊員，編為新四軍第二支隊，下轄第三、第四兩個團(tuán)，張鼎丞為支隊司令員，譚震林任副司令員。3月1日，張鼎丞、鄧子恢、譚震林率領(lǐng)第二支隊全體人員，告別了閩西父老兄弟，浩浩蕩蕩開赴皖南抗日前線。