馮異字公孫，潁川郡父城縣人。他愛好讀書，通曉《左氏春秋》《孫子兵法》。光武帝任司隸校尉時，經過父城。馮異立即開門奉獻牛酒迎接，被任命為主簿。王郎在邯鄲起事。劉秀率部眾自薊城疾馳南下，到達饒陽治下無萋亭時已深夜。正值天氣嚴寒，大家都感到疲勞饑餓，馮異急忙煮好豆粥供應。次日，劉秀對諸將說：“昨得公孫豆粥，饑寒俱解?！钡鹊搅四蠈m縣，又遇到大風雨，劉秀率領隨從到道旁空舍中避雨，馮異抱薪，鄧禹燒火，光武帝對灶燎衣。馮異又親自煮麥飯為之充饑。劉秀入據信都后，命馮異至河間招收兵馬，并拜為偏將軍。后馮異隨劉秀擊破王郎、平定河北，因功被封為應侯。

馮異為人謙讓，從不自夸，路上與其他將領相遇，總是讓自己的車到路邊避讓。進退都做好標記，軍中稱為最有秩序。每次軍隊停下來作短暫休息時，將領們都圍坐在一起講論戰(zhàn)功，馮異卻經常獨自避坐大樹之下，因此在軍中有“大樹將軍”的稱號。攻破邯鄲后，軍中調整將領部署，并分配各自的屬官。士官們都說愿意跟從大將軍,光武因此贊賞他。這個時候更始派舞陰王李軼、大司馬朱鮪、與河南太守武勃。率三十萬大軍共同鎮(zhèn)守洛陽。劉秀鞏固在河北的統(tǒng)治，城池完整，倉庫糧食充足，于是命寇恂為河內太守，馮異為孟津將軍，統(tǒng)率河內、魏郡二郡駐軍，共同抗御朱鮪、李軼。

馮異致書李軼說“”我聽說明鏡是用來照出原型的，追憶往事才能更好的洞察時事，從前微子離開殷商投奔周武王，項伯叛離項羽而歸附漢室，周勃迎代王而罷黜少帝，霍光尊奉孝宣而廢昌邑，這些人都是畏懼天意知曉天命，看到存亡的征兆，深諳盛衰的規(guī)律。因此能抓住成功的機遇，成就萬世的功業(yè)。假如長安的更始帝還值得扶助，還能繼續(xù)拖延時日，疏遠的人不離間超越親近的人，那么您怎么會被置放在邊遠的角落呢？今長安破敗混亂，赤眉軍逼近郊區(qū)，王侯發(fā)難，大臣叛離，法紀規(guī)矩，早已蕩然無存，四方分崩離析，劉姓之外的勢力紛然而起，所以蕭王才，苦心經營河北，這里英才俊杰云集，百姓人心齊向。您如果能明白成敗大勢，立即做出決斷，與古人比量功勞，轉禍為福，現在正是最好的時機，如果勇猛的將士長驅而來，部署軍隊包圍城池，您悔恨也來不及。

李軼給馮異回信說‘我本來是最早與蕭王謀劃共事中興漢室的，我們結下了生死之約，請向蕭王轉達我的心跡，我愿進獻策略，以輔助國家，安定百姓。李軼自從回信之后，就不再和馮異爭鋒相對了，馮異因此攻取北面的田井關，攻下了上黨郡的兩個城市，又南下平定了河南成皋以東的十三個縣以及各地軍隊屯聚之地。武勃帶著萬把人攻打投降的軍隊，馮異帶兵渡過黃河，與武勃在士鄉(xiāng)亭交戰(zhàn)，大敗武勃，殺敵五千多人，李軼還是關著城門，沒有援救武勃。馮異見他很講信用，用行動證明了忠心，就向光武上奏了事情的全部經過。光武故意泄露了李軼的書信。

朱鮪聞知大怒，派人刺殺李軼，于是城中人心離散，很多人投降。建武二年春，馮異定封陽夏侯、此時赤眉、延岑軍在三輔地區(qū)殘暴作亂，各郡縣大姓人家也都各自聚集兵馬，大司徒鄧禹無法平定他們，光武帝就派馮異代替鄧禹討伐他們。光武帝親自將他送到河南，賜給他自己的乘車和用寶玉裝飾的七尺寶劍。告訴馮異說:“三輔地區(qū)飽受王莽、更始政權的折磨，繼而又遭受赤眉、延岑軍馬的暴虐，黎民百姓飽受摧殘，沒有可以依靠與傾訴的對象。我們的征伐，不是為了侵占土地、搶掠城市，重要的是平定混亂，安定和睦百姓而已。那些將領不是不善于戰(zhàn)斗，但喜好搶掠。你本來就善于管理將士，希望再加強約束，不要再給郡縣增添痛苦。”馮異叩首領命，帶兵西征。

馮異在華陰遭遇赤眉軍雙方相持了六十多天交戰(zhàn)數十回合，降伏赤眉將領劉始、王宣等五千多人。建武三年春，光武帝派使者到軍中封馮異為征西大將軍。恰逢鄧禹帶著車騎將軍鄧弘等率軍東歸，與馮異相遇，鄧禹、鄧弘邀請馮異一同攻打赤眉軍。馮異說：“我和敵軍已經相持幾十天了，雖然屢次俘獲猛將，但赤眉軍還有很多的兵馬，我們可以慢慢用恩惠信用去誘使他們順服，難以一下子就用兵攻破他們?；噬犀F在派幾個將領屯扎在黽池，從東面攔截他們，而我從西面進擊，一舉拿下他們，這才是萬無一失的計劃。

鄧禹、鄧弘不聽。鄧弘和赤眉大戰(zhàn)一整天，赤眉假裝失敗，丟下軍需車輛逃走。車上裝滿了土，上面用豆子覆蓋著士兵饑餓，爭相搶奪。赤眉軍回頭痛擊鄧弘，鄧弘潰不成軍。馮異和鄧禹合力相救，赤眉軍才稍稍后撤。馮異認為士兵饑餓疲倦，可以暫且休戰(zhàn)，鄧禹不聽從，又投入戰(zhàn)斗，結果慘敗，死傷了三千多人。鄧禹得以逃脫到宜陽縣。馮異棄馬徒步逃到回溪阪，和幾個部下一起回到軍營。

加固了壁壘，聚集逃散的士兵，召集各營堡數萬兵馬，和敵軍約定日期會戰(zhàn)。馮異派壯士穿上和赤眉軍一樣的服裝，埋伏在路旁。第二天一早，赤眉軍派出萬人部隊攻打馮異前鋒部隊，馮異稍微派出一些兵力前去援救。赤眉軍見他們勢力單薄，就全軍出動攻打馮異，馮異于是全力出擊，大戰(zhàn)赤眉。太陽快要落山時，赤眉軍士氣衰退，這時埋伏的士兵突然沖出，他們的衣服和赤眉軍混在一起，赤眉軍無法識別敵我，很快就驚恐崩潰了。馮異乘勝追擊，在崤底大敗赤眉，降伏八萬男女。其余還有十多萬人馬，向東逃到宜陽也投降了。光武帝下璽書慰勞馮異說：“赤眉軍被攻破平定了，將士們都很辛勞。雖然開始在回溪阪遭到挫折，但最終還是在黽池重振羽翼，大功告捷。這可以說是‘失之東隅，收之桑榆’啊。我要論功行賞，以報答你們的功勞。

馮異自己覺得長久在外征戰(zhàn)，心里不踏實，就上書表白渴望回歸朝廷之心，愿意親自侍奉皇帝，光武帝不允許。后來有人上書說馮異在關中十分專制，斬殺長安縣令，有至高的權威，百姓都擁戴他，稱他為“咸陽王”。光武帝把奏章給馮異看。馮異十分惶恐，上書謝罪說：“我本一介書生，遇到受命的機會，成了漢軍的一分子，過分地蒙受圣上恩寵，高居大將之位，享有通侯的爵位，接受治理一方的使命，建立了微不足道的功勛，但這些都是圣上苦心思慮的成果，以臣下的愚昧是根本比不上的，我暗自思索：由天子下詔命令開戰(zhàn)，每次都能旗開得勝；偶爾私下做出征戰(zhàn)的決斷，就沒有一次不是有所后悔的。

皇上有獨到高明的眼光，時間越久越顯得深遠。我由此明白了‘人性與天道，是無法得知的’。在剛開始起兵，天下紛擾混亂的時候，豪杰競相崛起逐利，迷惑百姓的有上千人。我能遇上圣上，將自己交托給圣明，在危亂混沌之時，都不敢有什么閃失，何況現在天下太平，上下尊卑有序，而我卻要為自己的卑微爵位所蒙蔽，竟不知思量陛下的巍峨高大？我自始至終都想著謹遵您的旨意?，F在看到您給我看的奏章，戰(zhàn)戰(zhàn)粟粟，驚恐萬狀，我深知圣明的主上了解微臣的愚鈍品性，所以才敢借機表白自己的心跡。光武帝下詔回復說；將軍您忠于國家，謹遵君臣大義，恩情親如父子，有什么可嫌疑和恐懼的呢？

建武六年春，馮異進京朝見光武帝，光武召見他，并對公卿說；他是我起兵時的主簙，為我劈荊斬刺，平定關中。之后讓中黃們賜給他珍寶，衣服，錢幣，布帛，下詔說；窘迫危急時馮異在無萎亭送來豆粥，在沱河送上麥飯，濃厚情誼久久沒能報答。馮異叩首謝恩說，我聽說管仲曾對齊桓公說過，希望您不要忘記我曾射中您的帶鉤，我也不會忘記您押解我的囚車，齊國就是依靠這種信任關系壯大起來的。我也希望圣上不要忘記河北的艱難日子，我也不敢忘記在巾車鄉(xiāng)受到的恩遇，之后光武多次宴請馮異，商議收復蜀地之事，過了十幾天，才命令馮異帶著妻子兒女返回關中。

后來諸將領在隴右被隗囂打敗，于是光武命馮異進軍栒邑。馮異還沒有到，隗囂派部將王元、行巡率領二萬多人下隴，因而分遣行巡攻取栒邑。馮異即刻驅兵，準備搶先占據栒邑。諸將都說：“隗囂兵盛而且是乘勝而來，不可與他相爭。應在便利的地方把軍隊停下，慢慢思考方略?！瘪T異說：“隗囂兵臨境，習慣于爭奪小利，就想乘勢深入。如奪取了栒邑，就會使三輔動搖，是我的憂慮。兵法說‘攻者不足，守者有余’。現在先占據城邑，以逸待勞，并不是與他相爭。暗中進城關閉城門，偃旗息鼓，行巡不知道，奔往栒邑。馮異乘其不意，驟然擊鼓建旗殺出，行巡軍驚慌錯亂奔走，馮異追擊數十里，大破行巡。建武十年馮異病逝于在軍中，謚曰節(jié)侯。