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案例分享 | 基因檢測輔助診斷罕見病——遺傳性痙攣性截癱

 OnceApple 2019-08-19


臨床信息:患者,男性,67歲;身腓骨肌萎縮癥?患者母親兩個弟弟都有走路不穩(wěn)、剪刀腳病史。

檢測內(nèi)容:醫(yī)學(xué)外顯子測序。

采用高通量測序技術(shù)對4503個常見遺傳疾病相關(guān)基因進行全外顯子區(qū)域測序,檢測范圍包括基因編碼區(qū)單核苷酸位點變異(SNV)、小片段插入/缺失(INDEL)。

檢出1個匹配受檢者臨床表型的疑似致病的基因變異:SPAST基因c.A1216G:p.I406V雜合變異。

變異基因解讀:

注:“.”:無注釋;蛋白預(yù)測:Revel評分>0.5提示可能有害;人群頻率:gnomAD_exome_EAS。

OMIM表型簡介:

主要臨床表現(xiàn):

眼球震顫(罕見);尿急,尿失禁,括約肌障礙;下背痛;下肢痙攣,下肢無力,痙攣性步態(tài),反射亢進,錐體征,外側(cè)皮質(zhì)脊髓束退化,認知減退,記憶障礙,語言表達缺陷,精神發(fā)育遲滯(罕見),癡呆(罕見),橋小腦角蛛網(wǎng)膜囊腫(1例報道);下肢振動感減少;激動,攻擊,冷漠,抑郁;其他:發(fā)病年齡可變(嬰兒期至63歲),發(fā)病隱匿,進展性疾病,表型高度可變,遺傳早現(xiàn),遺傳異質(zhì)性。

GeneReviews: https://www.ncbi.nlm./books/NBK1160/。

變異位點一代驗證

先證者:

結(jié)果顯示該位點為雜合變異(SPAST:NM_014946:exon9:c.A1216G:p.I406V)

遺傳咨詢建議

1. 疾病外顯率與年齡、性別有關(guān),建議結(jié)合實際情況隨診受檢者及母親、兩個舅舅的臨床表型,以進一步明確檢出變異臨床意義。

2. 受檢者檢出變異有50%概率遺傳給子代,結(jié)合隨診行遺傳咨詢。

3. 建議結(jié)合實際情況,考慮對受檢者相關(guān)親屬進行該變異位點一代驗證,以評估患病風(fēng)險

■ ■   ■ ■ 

一、遺傳性痙攣性截癱

遺傳性痙攣性截癱(hereditary spastic paraplegia,HSP)是一組以漸進性雙下肢痙攣性截癱、步態(tài)異常為主要表現(xiàn)的神經(jīng)系統(tǒng)遺傳變性病。本組疾病具有明顯的臨床和遺傳異質(zhì)性。臨床表型分為單純型和復(fù)雜型兩大類,遺傳方式分為常染色體顯性遺傳、常染色體隱性遺傳和X連鎖遺傳。單純型HSP神經(jīng)系統(tǒng)受累較為集中,以緩慢進行性雙下肢痙攣性癱瘓為主要表現(xiàn),可合并高張力性排尿障礙和輕度深感覺障礙。復(fù)雜型HSP則在此基礎(chǔ)上合并其他神經(jīng)系統(tǒng)損害,如共濟失調(diào)、認知障礙、癲癇、錐體外系受累、周圍神經(jīng)病等。目前已發(fā)現(xiàn)HSP的致病基因超過70種,還有部分類型已經(jīng)在染色體初步定位,但尚未明確具體致病基因。

遺傳性痙攣性截癱主要類型與相應(yīng)致病基因:

疾病

致病基因

AD-HSP

ATL1、SPAST、NIPA1、WASHC5、ALDH18A1、KIF5A、RTN2、HSPD1、BSCL2、REEP1、ZFYVE27、SLC33A1、VAMP1

AR-HSP

CYP7B1、SPG7、SPG11、ZFYVE26、ERLIN2、SPART、SPG21、B4GALNT1、DDHD1、KIF1A、FA2H、PNPLA6、C19orf12、GJC2、NT5C2、GBA2、AP4B1、AP5Z1、TECPR2、AP4M1、AP4E1、AP4S1、VPS37A、DDHD2、C12orf65、CYP2U1、TFG、ARL6IP1、ERLIN1、AMPD2、ENTPD1、IBA57、MAG、CAPN1、FARS2、ALDH3A2、ALS2、KIF1C、MARS2、MTPAP、AFG3L2、SACS

X連鎖HSP

L1CAM、PLP1、SLC16A2

復(fù)雜型HSP異質(zhì)性強,疾病表型與肌萎縮側(cè)索硬化、共濟失調(diào)、腦白質(zhì)病變、周圍神經(jīng)病存在重疊,在分類有一定爭議,診治方法也差異較大。單純型HSP是遺傳性痙攣性截癱的經(jīng)典類型,存在更多共性。下面以常見的單純型HSP4型(或SPG4)為代表,介紹相關(guān)診療常規(guī)。

二、病因和流行病學(xué)

1. 遺傳性痙攣性截癱4型(HSP4)是由于SPAST基因缺陷所致的單純型遺傳性痙攣性截癱。HSP4是最常見的常染色體顯性HSP(autosomal dominant HSP,AD-HSP),占所有AD-HSP的40%~45%。

2. HSP總體患病率約在2/100 000~6/100000。愛爾蘭的流行病學(xué)研究顯示,單純型AD-HSP患病率為1.27/100000。

三、臨床表現(xiàn)

HSP4型通常在青年早期(但1歲至76歲起病均有報道)隱匿起病。主要表現(xiàn)為緩慢進展的雙下肢痙攣性癱瘓,查體可見錐體束征(腱反射亢進,踝陣攣陽性、病理征陽性)。雙上肢反射也可亢進,但一般不影響上肢活動。超過一半的患者會有下肢近端力弱表現(xiàn)。約50%的患者查體中可發(fā)現(xiàn)雙踝音叉震動覺減低(一般不會消失),另約1/3的患者有排尿障礙。

隨著年齡增長,疾病逐漸進展,約20%的患者最終會喪失行走能力。在同一家系中,攜帶同一突變的不同患者,臨床癥狀輕重可有較大差異。

四、輔助檢查

輔助檢查對診斷和鑒別診斷非常重要。HSP4型輔助檢查如下:

1. 頭MRI

HSP4頭MRI可正常,部分患者可見輕度腦白質(zhì)病變,胼胝體略變薄、小腦輕度萎縮等,但一般不具特異性。頭MRI檢查更多是為了除外其他引起痙攣性截癱的腦部疾患。

2. 脊髓MRI

HSP4型脊髓MRI一般無異常信號,部分患者可見脊髓輕度變細。脊髓MRI更多是為了除外其他引起雙下肢痙攣性截癱的頸髓(包括延髓頸髓交界處)、胸髓疾病,如脊髓炎、多發(fā)性硬化等。

3. 誘發(fā)電位檢查

雙下肢運動誘發(fā)電位和體感誘發(fā)電位檢查均可發(fā)現(xiàn)波幅下降或消失,潛伏期延長等異常,與臨床癥狀有一定相關(guān)性。

4. 肌電圖和神經(jīng)傳導(dǎo)速度

HSP4型的肌電圖和神經(jīng)傳導(dǎo)速度一般正常,主要用于與復(fù)雜型HSP的檢查及與其他疾病相鑒別。

5. 基因檢測

HSP4型為基因缺陷性疾病,基因檢測是最重要的病因診斷。HSP4型致病突變約80%為微小突變,20%為大片段缺失或重復(fù)。對于微小突變,一般采用高通量測序,一次性完成全部外顯子測序。同時遺傳性痙攣性截癱亞型眾多,臨床表現(xiàn)相似,從臨床上區(qū)分非常困難,可通過包含所有HSP基因的panel一次性檢測,提高檢出率。SPAST基因大片段缺失或重復(fù)可采用多重連接探針擴增技術(shù)(MLPA)或定量PCR等方法進行檢測。

五、診斷

青年早期起病的雙下肢痙攣性癱瘓,合并雙踝音叉震動覺減低、排尿障礙,除外脊髓炎、脊髓壓迫等其他疾病,部分患者有遺傳家族史??膳R床疑診遺傳性痙攣性截癱。其中HSP4型為最常見類型?;驒z測發(fā)現(xiàn)SPAST基因致病性缺陷可確診。

六、鑒別診斷

HSP4型的鑒別診斷分為兩個層面。首先需與其他造成雙下肢截癱的疾病相鑒別,包括獲得性疾病和其他基因缺陷性疾病。其次,需與遺傳性痙攣性截癱的其他亞型相鑒別。

需重點鑒別的疾病如下:

1. 脊髓壓迫或牽拉

脊髓型頸椎病或較為少見的胸段脊髓壓迫以及脊髓栓系等結(jié)構(gòu)壓迫或牽拉性病因,可造成雙下肢截癱,需通過影像學(xué)檢查鑒別。

2. 脊髓血管病

可造成橫貫性或部分橫貫性脊髓損害,造成雙下肢截癱、感覺障礙及尿便障礙。動脈疾病常急性起病,但靜脈疾病,如脊髓動靜脈畸形,可緩慢上升性發(fā)展。

3. 脊髓炎(感染性或自身免疫性)

脊髓感染性炎癥,特別是HTLV-1所致熱帶痙攣性截癱需與遺傳性痙攣性截癱重點鑒別。另外,梅毒螺旋體感染所致脊髓癆,也可造成雙下肢截癱。血清學(xué)及腦脊液抗體檢測可資鑒別。自身免疫性脊髓炎,如視神經(jīng)脊髓炎、多發(fā)性硬化,同樣可造成橫貫或部分橫貫脊髓損害,但起病通常較急,可同時合并視神經(jīng)或腦部損害,腰穿發(fā)現(xiàn)相關(guān)抗體和寡克隆區(qū)帶有助于鑒別。

4. 代謝性疾病

遺傳代謝病,如高同型半胱氨酸尿癥、腦腱黃瘤病等,可造成雙下肢痙攣性癱瘓表現(xiàn),需注意鑒別。有些獲得性營養(yǎng)缺乏性疾病,如遺傳性或獲得性維生素B12缺乏或銅缺乏性脊髓病等也需鑒別。

5. 運動神經(jīng)元病

肌萎縮側(cè)索硬化,特別是原發(fā)性側(cè)索硬化,臨床表現(xiàn)與單純型遺傳性痙攣性截癱類似,在分類上也有一定重合。一般原發(fā)性側(cè)索硬化,起病更晚,卻發(fā)展更快,后期可出現(xiàn)上下運動神經(jīng)元同時受累的臨床表現(xiàn)。

6. 腦白質(zhì)營養(yǎng)不良

腎上腺腦白質(zhì)營養(yǎng)不良、異染性腦白質(zhì)營養(yǎng)不良等,輕型可成人起病,臨床表現(xiàn)與遺傳性痙攣性截癱類似,鑒別時需要考慮。

7. 脊髓小腦共濟失調(diào)

復(fù)雜型遺傳性痙攣性截癱,部分類型共濟失調(diào)癥狀明顯,需與SCA相鑒別。但兩類遺傳性疾病確有部分重合,分類尚存爭議。

8. 各亞型間鑒別

單純型與復(fù)雜型的區(qū)別主要是經(jīng)典癥狀外是否合并其他神經(jīng)系統(tǒng)受累表現(xiàn)。單純型遺傳性痙攣性截癱,具體亞型臨床鑒別困難,只能通過基因檢測進行鑒定。

七、治療

HSP4型通常發(fā)展緩慢,預(yù)后相對良好。治療原則為,確診后通過藥物治療、康復(fù)訓(xùn)練、多學(xué)科協(xié)作隨診評估,改善癥狀、提高生活質(zhì)量。

1. 藥物治療

根據(jù)下肢痙攣癥狀,給予口服巴氯芬等藥物降低雙下肢僵硬程度,改善活動能力。如口服治療效果欠佳,可考慮持續(xù)硬膜內(nèi)巴氯芬泵入治療;肉毒毒素治療,有助于進一步改善雙下肢痙攣癥狀。對于排尿障礙,應(yīng)行尿流動力學(xué)評估,根據(jù)病情加用抗膽堿能藥物,幫助控制尿失禁。

2. 康復(fù)治療

對于確診為遺傳性痙攣性截癱的患者規(guī)律康復(fù)治療非常重要。應(yīng)在有相關(guān)疾病治療經(jīng)驗的康復(fù)科醫(yī)師指導(dǎo)下長期堅持,有助于保持關(guān)節(jié)活動度,改善雙下肢僵硬程度。

3. 多學(xué)科聯(lián)合診治

為了延緩病程進展,需要多學(xué)科聯(lián)合診治。包括神經(jīng)科、泌尿科、康復(fù)科、心理醫(yī)學(xué)科等。

八、診療流程

隱匿起病、緩慢進展的雙下肢痙攣性癱瘓

可伴有排尿障礙

符合常染色體顯性遺傳家族史

詳細詢問病史

(包括起病年齡、癥狀進展、家族史等)

查體可見雙下肢為主錐體束征,雙踝音叉震動覺減低

運動誘發(fā)電位、體感誘發(fā)電位示波幅下降、潛伏期延長

頸椎、胸椎MR除外脊椎壓迫、髓內(nèi)異常信號

頭MR除外彌漫性腦白質(zhì)病變、炎性脫髓鞘

SPAST基因檢測發(fā)現(xiàn)致病突變

明確診斷后,給予治療隨診和遺傳咨詢

參考信息:

[1] Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology.

[2] Kalia SS, Adelman K, Bale SJ, et al. Recommendations for reporting of secondary findings in clinical exome and genome sequencing, 2016 update (ACMG SF v2.0): a policy statement of the American College of Medical Genetics and Genomics[J].Genet Med. 2017 Feb;19(2):249-255.

[3] 王秋菊, 沈亦平, 鄔玲仟,等. 遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南[J]. 中國科學(xué):生命科學(xué), 2017(6).

[4] 罕見病診療指南(2019年版)

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