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把線粒體的蛋白也提取出來

 微笑如酒 2019-02-13

果子導(dǎo)讀

這篇帖子本來應(yīng)該是大年初一發(fā)的的,但是我給忘記了。今天補(bǔ)上。
看到豆子今天的帖子和感想,能有這樣優(yōu)秀的伙伴在身邊是一種幸運(yùn)。提蛋白只是一個(gè)簡單的操作,但是豆子老師連講了5期,這只是她技能的一個(gè)小點(diǎn),還有一大批帖子等著我們,這一年,有高師姐和豆子老師在,我自己很期待。
本來還想講幾句,但是此刻心里翻江倒海,五味雜陳,不知道如何開口。醫(yī)院前門的包子鋪沒有開,導(dǎo)致我?guī)滋鞗]有吃早飯,后門沒有什么餐館開門,中午就像游魂一樣找吃的,昨天開始消毒細(xì)胞培養(yǎng)箱,整個(gè)過程需要兩天。
過年會給連續(xù)的工作帶來打擊,工作的停頓從放假前3天就開始,一直持續(xù)到放假后3天,加起來都要兩周,而那種因?yàn)榉偶俣O聛淼臒崆?,不知道要什么時(shí)候才能完全恢復(fù),老家還有一句話,正月里面都是年。

以下是今天豆子老師的正文:


最近看了很多場的團(tuán)拜會的表演,覺得好像有種說不出的感覺,但恍惚中星星點(diǎn)點(diǎn)仿佛照亮了什么,自己好像是舞蹈隊(duì)的隊(duì)長,一場下來有時(shí)候會表演四五個(gè)節(jié)目,自己好像愛好唱歌,音樂老師都說挺好的(可能只是鼓勵,反正我把他當(dāng)真了),自己能吹豎笛還是滿分,鼓樂隊(duì)的都特別想要我,但是還是被舞蹈隊(duì)打敗了,O(∩_∩)O~,自己仿佛朗誦的也不錯(cuò),脫稿演講也有那么多次,自己或許文章寫的還可以,還上過報(bào)紙。。。

原來竟是勾起了自己塵封多年的記憶。我們有不同的自己,可以高山流水,陽春白雪,可以喜歡李煜潛來珠簾動,驚覺銀屏夢,可以有長江東去浪淘盡的魄力,可以有潤物細(xì)無聲的溫柔,有惟吾德馨的高雅,平平凡凡也是不錯(cuò)。不管做何種選擇,自己一定是舒服的開心的就好,所以我看到很多人說好像自己忘記了很多東西,我覺得其實(shí)并不是忘記了,只是沒有一個(gè)契機(jī)讓自己想起來,你的記憶就放在那里等你去取,但是放在哪里卻需要自己去找。

今天講講線粒體蛋白的提取

線粒體的重要性我想大家肯定都知道,線粒體主要是提供細(xì)胞內(nèi)各種物質(zhì)代謝所需要的能量。能量是我們進(jìn)行一切事情的前提條件,想要研究線粒體的功能以及物理化學(xué)性質(zhì),提取線粒體必不可少,線粒體大量存在于代謝旺盛的細(xì)胞中,如動物的心肌,腦,肝,腎等器官和組織的細(xì)胞中,今天也是照舊提到幾種方法。

總的來說提取線粒體的過程大概是先破碎細(xì)胞保存線粒體的活性,再梯度離心分離線粒體,最后破碎線粒體,提取線粒體蛋白。

為保證獲得完整的線粒體,務(wù)必做到:第一,全程低溫操作;第二,快速;第三,在不破壞亞細(xì)胞器的情況下破碎細(xì)胞,這是制備線粒體的最關(guān)鍵環(huán)節(jié)。

  • 1.細(xì)胞(至少2 ×10^7個(gè),最少一個(gè)10cm的dish,最好至少用兩個(gè))PBS洗3次。

  • 2.收集細(xì)胞,先將細(xì)胞用PBS收集,再離心,棄掉PBS。

  • 3.收集沉淀,用1ml 2mM HEPES勻漿,須在冰上操作,研磨30-40次。

  • 4.4℃,800g離心10 min,收集上清于一新EP管中。

  • 5.將上清以4℃, 11,000g離心15 min,將得到的沉淀用RIPA緩沖液洗滌并重懸,放于冰上15 min, 4 ℃, 10,000g離心10 min,收集上清即為線粒體蛋白

BSA的作用是為了去處內(nèi)生的游離脂肪酸,甘露醇和蔗糖是為了建立一定的滲透壓。

組織線粒體的提取(以腦組織為例)

A液:甘露醇0.3mol/L,EDTA 0.1mmol/L,PH=7.4,使用前加無脂肪酸的BSA 1g/L

  • 1.取新鮮腦組織,PBS沖洗,洗凈血水,冰浴中剪碎,加入A液,勻漿,組織研磨20次。

  • 2.將組織勻漿物轉(zhuǎn)移到離心管,4℃,3000rpm離心10 min,棄去沉淀。

  • 3.取上清,轉(zhuǎn)移至新的離心管中,4℃,10,000rpm再次離心10 min,留取沉淀即為腦線粒體。

還有一種提取組織線粒體的方法,但是需要用低溫超高速離心機(jī),如果有的話可以可以選擇。

組織線粒體提取2:

A液:0.32mol/L蔗糖、10mmol/L EGTA、50mmol/L Tris-HCl,PH=7.4
B液:0.32mol/L 蔗糠、50mmol/L Tris-HCl,PH=7.4

  • 取組織如前,加入A液勻漿,1000g離心10 min,

  • 取上清液17,000g離心20 min,沉淀置于B液中,

  • 在質(zhì)量濃度為75g/L,120g/L 聚蔗糖組成的不同密度梯度上,以68,000g離心1 h,其沉淀物即為線粒體,

  • 置于B液中存于-80℃。

試劑盒提取線粒體:(SM0020)

組份:

  • Lysis Buffer

  • Mito-Wash Buffer

  • Store Buffer

  • 1. 樣本處理
    a. 組織勻漿:稱取100-200mg新鮮組織腦組織,PBS沖洗3次,洗凈血水,濾紙吸干,用剪刀剪為碎塊放入小容量玻璃勻漿器內(nèi)。加入1.0ml冰預(yù)冷的Lysis Buffer,0℃冰浴上下研磨組織20次;
    b. 培養(yǎng)細(xì)胞勻漿:PBS 洗滌,800g 離心10 min收集細(xì)胞,計(jì)數(shù)。每次提取需要5×107(至少2盤10cm dish是細(xì)胞)個(gè)細(xì)胞,加入1.0 ml冰預(yù)冷的Lysis Buffer 重懸細(xì)胞,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到小容量玻璃勻漿器內(nèi),0℃冰浴研磨30-40次

(與組織塊相比,培養(yǎng)細(xì)胞特別是貼壁培養(yǎng)細(xì)胞在用玻璃勻漿器勻漿時(shí)較難破壁,因而要選用小容量玻璃勻漿器、間隙嚴(yán)密的研杵上下研磨培養(yǎng)細(xì)胞)。

  • 2. 將組織或細(xì)胞勻漿物轉(zhuǎn)移到離心管,4℃,1000g離心5 min。

  • 3. 取上清,轉(zhuǎn)移至新的離心管中,4℃,1000g再次離心5 min。

  • 4. 取上清,轉(zhuǎn)移至新的離心管中,4℃,12,000g離心10 min。離心后的上清含胞漿成分,可從中提取胞漿蛋白。將上清轉(zhuǎn)移到新離心管,線粒體沉淀在管底。

  • 5. 往線粒體沉淀中加入0.5 ml Wash Buffer重懸線粒體沉淀,4℃,1000g離心5 min。

  • 6. 取上清,轉(zhuǎn)移至新的離心管中,4℃,12,000g離心10 min。棄上清,高純度的線粒體沉淀在管底。

  • 7. 用50-100 ul Store Buffer 或合適的反應(yīng)緩沖液重懸線粒體沉淀,立即使用或-80℃保存。

最好用Bradford法測定線粒體濃度,對比Bradford法(考馬斯亮藍(lán))和BCA法,兩者都有干擾物質(zhì),但相比之下Bradford法的干擾物質(zhì)影響更小一點(diǎn)

以下為兩種方法對DTT、EDTA、EGTA和蔗糖等的最大允許濃度


這是豆子的實(shí)驗(yàn)專欄,下周二再會。

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