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學(xué)術(shù)干貨 | 核磁共振好基友MestReNova—手把手教你做出一張核磁譜圖

 Moia藏經(jīng)閣 2017-01-30

核磁共振(NMR,Nuclear Magnetic Resonance)是基于原子尺度的量子磁物理性質(zhì)。具有奇數(shù)質(zhì)子或中子的核子,具有內(nèi)在的性質(zhì):核自旋,自旋角動量。核自旋產(chǎn)生磁矩。NMR觀測原子的方法,是將樣品置于外加強大的磁場下,現(xiàn)代的儀器通常采用低溫超導(dǎo)磁鐵。核自旋本身的磁場,在外加磁場下重新排列,大多數(shù)核自旋會處于低能態(tài)。我們額外施加電磁場來干涉低能態(tài)的核自旋轉(zhuǎn)向高能態(tài),再回到平衡態(tài)便會釋放出射頻,這就是NMR訊號。利用這樣的過程,可以進(jìn)行分子科學(xué)的研究,如分子結(jié)構(gòu)、動態(tài)等。

在對核磁進(jìn)行分析的時候,小伙伴們一定離不開MestReNova這個基礎(chǔ)軟件。簡單的分析想必大家都會,可是如果是要放在文章里的話,可能就需要下一番功夫了。今天小編帶領(lǐng)各位看官一起做一張可以放在文章中的核磁譜圖。(多圖預(yù)警)


第一步:定標(biāo)


要分析核磁圖,首先要先會打開它(以小編做的一個材料為例,溶劑為CDCl3)。打開文件夾,選擇任意一個文件(以acqus為例)后選擇用MestReNova打開。我們最常用的就是下圖中紅色框內(nèi)的幾個按鈕了。



打開之后的軟件界面如下圖。



首先用下圖中紅框按鈕對想著重觀察的區(qū)域放大,一般情況下我們首先觀察芳香區(qū),也就是化學(xué)位移在7左右的區(qū)域。



用紅框中的鍵對溶劑峰定標(biāo)(選擇7.26附近的峰,將ppm值改為7.26)




第二步:標(biāo)峰


選擇圖中紅框圖標(biāo),采用人工標(biāo)峰??蜻x出你要標(biāo)的峰,然后松手。



峰的化學(xué)位移值如下圖所示。烷基區(qū)同上。



第三步:積分


選擇圖中紅框選中按鈕選擇人工積分。標(biāo)定之后如圖中所示。



第四步:標(biāo)定偶極矩


選擇圖中紅框選中按鈕,選擇“Automatic”。



電腦就會自動對已經(jīng)已經(jīng)積分的部分進(jìn)行計算。結(jié)果如下圖所示。



一般來說,文章正文中不會出現(xiàn)核磁譜圖,核磁譜圖通常會放在supporting information里,文章正文中通常放文字。那么怎么將核磁圖轉(zhuǎn)化為文字呢?不要著急 ,且聽我一一道來。


點選“Report”,在圖表中就會出現(xiàn)核磁的文字分析結(jié)果。



選中之后,就可以直接黏貼在你的正文中了(別忘了刪除框框哦)。


第五步:修飾、美化


分析正確之后,如果直接把這樣的譜圖放在文章里,總覺得和白花花的背景有些維和,為了讓圖譜看的更加和諧,我們就需要對其進(jìn)行美化。


選擇圖中紅框的“小手”,然后在空白處雙擊左鍵。


 

選擇右邊第2個選項卡,按圖中所示,勾選掉3中的兩個對鉤,這樣圖譜中背景就會變成空白。



勾選掉“Vertical”,這樣圖譜中的縱坐標(biāo)就沒有了。



選擇第3個選項卡,如圖所示,選擇合適的字體字號等。



選擇第4個選項卡,如圖所示,將“Curve”勾選掉,去掉曲線;將2%改為3%,將積分上移。



最后選擇“OK”這樣你就得到了一張漂亮的核磁圖了。



為了使圖形在放大縮小時不失真,我們需要把圖形保存為矢量圖。


選擇File,save as,將保存類型設(shè)為tiff,保存為矢量圖。



這樣,一張可以放到文章中的標(biāo)準(zhǔn)NMR圖就出爐了!


總結(jié):

總體流程就是:定標(biāo)、標(biāo)峰、積分、標(biāo)定偶極矩、美化。



如果能結(jié)合著Chemdraw,將化學(xué)分子式貼入核磁譜圖中

少年,發(fā)Nature就指日可待了!


(Chemdraw使用教程參看學(xué)術(shù)干貨|化工材料學(xué)子基礎(chǔ)入門必備–ChemDraw的使用方法)


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