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科學(xué)網(wǎng)—談?wù)刧nuplot(二十四):擬合

 大老淵 2013-07-17

談?wù)刧nuplot(二十四):擬合

已有 1888 次閱讀 2011-11-9 09:05 |個(gè)人分類(lèi):開(kāi)源軟件|系統(tǒng)分類(lèi):科研筆記|關(guān)鍵詞:gnuplot 數(shù)學(xué) 軟件 畫(huà)圖 擬合 fit

gnuplot 除了繪圖功能之外,最簡(jiǎn)單實(shí)用的功能就是擬合了。gnuplot 可以進(jìn)行單變量甚至多變量的線性和非線性擬合。雖然可能不像專(zhuān)門(mén)的數(shù)學(xué)軟件那么強(qiáng)大,但是足以對(duì)付日常需要了。我們拿上一篇文章里的數(shù)據(jù)來(lái)舉例子。

首先,要定義一個(gè)待擬合的函數(shù):
gnuplot> f(x)=50*(1+erf(a*(x-b)))
這里使用了誤差函數(shù) erf(x),有兩個(gè)待定的參數(shù):a, b。下面我們生成一個(gè)文件“fit.par”,里面包含的是參數(shù) ab 的初值:
a = 1
b = 12

初值的選擇要盡可能貼近結(jié)果,否則可能導(dǎo)致誤差甚至無(wú)法收斂。下面我們進(jìn)行擬合:
gnuplot> fit [8:16] f(x) 'probability.dat' using 1:2 via 'fit.par'
gnuplot 里面關(guān)于擬合的命令是 fit,后面的自變量取值范圍不是必需的。f(x) 函數(shù)已經(jīng)在上面定義過(guò)了,數(shù)據(jù)文件“probability.dat”也已經(jīng)在上一篇博文中交代過(guò)了。via 后面跟的是參數(shù)變量列表文件。執(zhí)行 fit 命令之后,gnuplot 會(huì)輸出一堆結(jié)果。我們忽略那些中間運(yùn)算,只把最后結(jié)果貼在下面:

After 5 iterations the fit converged.
final sum of squares of residuals : 41.9399
rel. change during last iteration : -4.27973e-07

degrees of freedom    (FIT_NDF)                        : 8
rms of residuals      (FIT_STDFIT) = sqrt(WSSR/ndf)    : 2.28965
variance of residuals (reduced chisquare) = WSSR/ndf   : 5.24249

Final set of parameters            Asymptotic Standard Error
=======================            ==========================

a               = 1.15661          +/- 0.06331      (5.474%)
b               = 11.9027          +/- 0.02383      (0.2002%)


correlation matrix of the fit parameters:

               a      b     
a               1.000
b               0.014  2.000


這段文字說(shuō)明,經(jīng)過(guò) 5 次迭代,gnuplot 得到了收斂的結(jié)果。中間部分是參數(shù) ab 的最終取值以及漸近標(biāo)準(zhǔn)差(asymptotic standard error)。漸近標(biāo)準(zhǔn)差的計(jì)算是基于線性擬合的,對(duì)于非線性擬合,漸近標(biāo)準(zhǔn)差一般都比真的標(biāo)準(zhǔn)差小,所以這個(gè)數(shù)字只能用于定性分析。而最后給出的相關(guān)矩陣(correlation matrix)可以幫助我們確認(rèn)漸近標(biāo)準(zhǔn)差的可靠度,非對(duì)角元素絕對(duì)值越小,漸近標(biāo)準(zhǔn)差越接近真實(shí)標(biāo)準(zhǔn)差。

好了,現(xiàn)在我們可以把數(shù)據(jù)和擬合曲線畫(huà)在同一張圖上了:
gnuplot> set xrange [8:16]
gnuplot> set yrange [-5:105]
gnuplot> unset key
gnuplot> set xlabel "Laser Pulse Energy (μJ)"
gnuplot> set ylabel "Bubble Formation Probability (%)"
gnuplot> plot "probability.dat" using 1:2:3:4 with xerrorbars, f(x) lw 2 lc rgb "orange"

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