生物學家也猜，可能和媽媽的免疫反應(yīng)有關(guān)。媽媽懷孕時的免疫反應(yīng)會針對男胎腦細胞上的一種蛋白質(zhì)，這種蛋白質(zhì)可能在胚胎發(fā)育過程中非常關(guān)鍵，于是媽媽的免疫反應(yīng)就會改變胎兒的大腦功能。如果這種蛋白質(zhì)恰好是Y染色體上的基因編碼的，免疫反應(yīng)就會隨著懷男孩次數(shù)增加而變得強，也就解釋了后出生的孩子同性戀概率大。現(xiàn)在科學家已經(jīng)找到了一些Y染色體編碼的、能引起懷孕媽媽免疫反應(yīng)的蛋白質(zhì)，只是這些蛋白質(zhì)和性取向之間還沒建立起必然聯(lián)系。如今還處在假說階段，可免疫反應(yīng)聽起來可比亂倫的性騷擾靠譜多了。

生物學家要問的問題，除了How（分子機制），還有Why（演化機制）。如果達爾文他老人家在世，也一定會為這個問題大傷腦筋。只在男性統(tǒng)計，同性戀產(chǎn)生后代僅為異性戀的20%，明顯這個性狀降低了生殖力，那同性戀基因（們）為什么沒有被殘酷的自然選擇所淘汰呢？它看來違背了達老的金科玉律，“自然選擇，其實就是選那些能生的”嘛。

最早的猜測是親緣選擇（kin selection）。而最早提出親緣選擇的又是達老。他說，某些情況下自然選擇選的不是個人，而是彼此有親緣關(guān)系的群體。如今信息時代，連生物都信息化了，就更容易理解，生物由基因編碼，個體在照顧親人的同時，其實是在照顧和自己一樣的基因，也算“間接”產(chǎn)生下一代了。為了豐富這個觀點，有人說，同性戀也可以做對社會有益的事嘛，捕個獵啦，做牧師拯救親人精神世界啦；有人抓住“出生順序關(guān)乎性取向”的現(xiàn)象，說前面出生的哥哥反正已經(jīng)把家里資源瓜分完畢，那么小兒子不生育也不會造成多大的額外損失；還有人說，同性戀男子一般做事更為他人著想，然而別忘了，胸懷天下不頂事，只有對自己親戚好才有演化意義。后來有人認真做了一把實驗，結(jié)果發(fā)現(xiàn)同性戀和異性戀一樣冷酷無情，非但沒給家里更多錢，對照顧兄弟姐妹的小孩也沒太迫切的興趣（他們也有個人私生活?。图彝ミ€有那么一點點疏遠……

既然同性戀自己并沒有特意照顧自己的基因好好傳遞，那另一個可能的解釋是，同性戀基因傳遞下去是權(quán)宜之計：在純合的極端狀況下降低生殖能力；但如果適度，比如當這個基因雜合時，或者當攜帶一系列同性戀基因中的幾個時，反而能提高基因攜帶者的生殖力（和鐮狀細胞貧血癥基因的效果似的，純和會影響供血，然而雜合卻能幫人對抗瘧疾）。于是對于一個群體來說，同性戀基因（們）對傳宗接代起的壞作用就被好作用抵消了。生物學上確實有這樣的概念來描述這個現(xiàn)象，那就是平衡多態(tài)現(xiàn)象。

還是始于觀察，接著是一通問卷統(tǒng)計，當然問卷是在沒有計劃生育政策的國家發(fā)的，最后發(fā)現(xiàn)同性戀的母系那邊通常是大家庭，也就是說生育力旺盛（這個現(xiàn)象和前面說的同性戀關(guān)鍵基因定位在X染色體是相符合的。X和Y是性染色體，XX組合是女性，XY是男性，父系的男子和主人公有共同的Y染色體，X染色體卻不同，于是就和這個故事不搭嘎了），相比來說，異性戀的母系那邊就遜多了。于是科學家推測，X染色體上的同性戀基因（們）導致男性同性戀，但它在女性基因組中是雜合的，可能反而讓她們更有生育力，不管是因為更能生，還是因為這些攜帶了同性戀基因的女性更誘人。如此這般，同性戀基因影響了某些人生育，但利于另一些人生育后代，總的效果在人群中得到平衡，基因就可能通過這樣的方式源遠流長了。

有人發(fā)現(xiàn)了另一種“平衡”方式。不管是男是女，同性戀基因攜帶者一生中性伴侶數(shù)目較多。比如，雙胞胎中一個是同性戀而另一個是異性戀的情況，同雙胞胎中倆都是異性戀的情況相比，前面一對（異-同）里異性戀的這位，就比后面一對（異-異）里的異性戀更討異性歡迎。只是這種平衡方式也還有待商榷，至少異-同組合下，家里肯定會給這位異施加更多壓力，讓他傳宗接代……

那為什么同性戀基因攜帶者可能更討人喜歡呢？有人給出了試探性的猜測，如果男性攜帶同性戀基因，不到同性戀的程度，卻帶有一些同性戀男人的優(yōu)點，比如細心、敏感、溫柔、不那么強勢。他們可能不是一個床上功夫和叢林戰(zhàn)斗力了得的猛男，卻是一個好丈夫——畢竟天下大多數(shù)孩子肯定是這樣的爸爸照顧出來的。而且有調(diào)查表明，超級陽剛的臉孔其實并不是最吸引一般女性的，受歡迎的往往是帶點女人味兒的。于是在女人的選擇下，同性戀基因（們）就傳遞下去了。相反，自然界中的雌性往往要獨自承擔哺育后代的責任，稍微有點強勢的就比較有生殖優(yōu)勢了。