水是一種良好的溶劑。水中往往溶解著一定量的無機(jī)和有機(jī)物質(zhì)，可供微生物生長繁殖。然而，清潔水體的微生物含量并不高，通常每 ml 水中只有幾十至幾百個(gè)細(xì)菌。清潔水體的微生物以自養(yǎng)菌為主，對人類無害。常見的化能自養(yǎng)型細(xì)菌有硫細(xì)菌、鐵細(xì)菌、鞘細(xì)菌。光能自養(yǎng)型細(xì)菌有綠細(xì)菌、紫細(xì)菌和藍(lán)細(xì)菌。另外還有無色桿菌屬、色桿菌屬和微球菌屬等腐生性細(xì)菌。
然而，清潔水體經(jīng)常受到土壤、垃圾、人畜糞便、以及各種污水的污染。一旦這些污染物中的病原菌進(jìn)人水體，或這些污染物引起某些藻類大量繁殖，就可使水質(zhì)嚴(yán)重惡化，危害人類。
（一）可檢出的病原菌及其危害

霍亂弧菌
1. 病原性細(xì)菌
沙門氏菌屬 （ Salmonella ） 在病人糞便、畜欄糞污和屠宰場污水中，均可攜帶沙門氏菌。將這些廢物排入水體，便可能引起沙門氏菌污染。如果排至水產(chǎn)養(yǎng)殖場，還可能污染水產(chǎn)品。沙門氏菌屬中的傷寒沙門氏菌（ Salmonella typhi ）和副傷寒沙門氏菌（ Salmonella paratyphi ）分別是傷寒和副傷寒疾病的病原菌。有些沙門氏菌則可引起急性腸胃炎，造成食用者的集體中毒。
志賀氏菌屬 (Shigella ) 存在于菌痢患者和短時(shí)帶菌者的糞便中。水體遭受菌痢患者的糞便污染時(shí)，從中捕得的魚體內(nèi)可檢測到這屬細(xì)菌。志賀氏菌病主要通過食物或接觸傳染，假如飲用水源受到污染，極有可能導(dǎo)致水型痢疾的暴發(fā)流行。
霍亂弧菌 可引起霍亂病，它是一種通過飲用水傳播的烈性傳染病。
致病性大腸桿菌 糞便中的某些大腸桿菌能引起水瀉、嘔吐等病癥，稱為致病性大腸桿菌。其中，有的大腸桿菌能產(chǎn)生腸毒素而導(dǎo)致強(qiáng)烈腹瀉，稱為產(chǎn)腸毒素大腸桿菌。因此，攜帶致病性大腸桿菌的糞便污染水體時(shí)，可產(chǎn)生嚴(yán)重的惡果。
2 、鉤端螺旋體
存在于已受感染的動(dòng)物（如豬、馬、牛、狗、鼠等）的尿液內(nèi)、能以水為媒介，通過破損的皮膚或粘膜侵人人體，引起出血性鉤端螺旋體病。
3 、病毒
存在于人的腸道里 并能通過糞便污染水體。在水型暴發(fā)的病毒性傳染病中，研究較多的是傳染性肝炎。流行病學(xué)調(diào)查證明，在世界各地傳播的傳染性肝炎 主要由水體污染所致。
4 、寄生蟲
溶組織阿米巴是阿米巴痢疾的病原體，又稱痢疾變形蟲。阿米巴痢疾主要通過糞便污染食物和飲用水而傳播。
防治水體病原微生物污染的主要措施是：① 加強(qiáng)對污水的處理。對于醫(yī)院、畜牧場、屠宰場和禽蛋廠等部門的污水，必須處理達(dá)標(biāo)，否則不許排放。 ② 加強(qiáng)對飲用水的處理。飲用水必須符合水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)。對于農(nóng)村的分散式給水 應(yīng)采用煮沸或加漂白粉等方式消毒，以殺死水中可能存在的病原體。
（二）富營養(yǎng)化及其危害

水華:淡水水體中的富營養(yǎng)化
赤潮:咸水水體中的富營養(yǎng)化
所謂富營養(yǎng)化是指含有氮、磷等營養(yǎng)物質(zhì)的廢水大量排入湖泊、河口、海灣等緩流水體，促使藻類以及其他浮游生物迅猛增殖，從而引起水質(zhì)惡化，導(dǎo)致魚類及其他生物大量死亡的現(xiàn)象。其指標(biāo)為：氮含量超過 0.2~0.3mg/L ，生化需氧量超過 10mg/L ，水中的細(xì)菌總數(shù)超過 10 5 個(gè) /L ，表征藻類數(shù)量的葉綠素 a 含量大于 10 μ g/L 。
在一般情況下，受氮、磷含量，特別是磷含量的限制，水體中藻類和浮游生物不致于過度增殖而出現(xiàn)富營養(yǎng)化。然而，當(dāng)水體受廢水污染時(shí)，營養(yǎng)物質(zhì)的增加可導(dǎo)致自養(yǎng)型生物，尤其是藻類的劇增，生物種群也因此而改變。例如，水體中的藻類本來以硅藻為主，受污染后可變?yōu)橐运{(lán)藻為主。藍(lán)藻的大量出現(xiàn)是水體富營養(yǎng)化的明顯征兆。一旦水體達(dá)到富營養(yǎng)化指標(biāo)，即可顯示出富營養(yǎng)化帶來的危害。
富營養(yǎng)化的危害有：① 造成水體透明度下降，影響水生植物的光合作用。② 某些浮游生物可產(chǎn)生生物毒素（如石房蛤毒素），傷害魚類。③ 藻類及其他水生生物死亡后，其殘?bào)w被好氧微生物降解而消耗水中的溶解氧。其殘?bào)w被厭氧微生物降解則可產(chǎn)生硫化氫等有害氣體，它們均可危及水生生物（主要是魚類）的生存。④ 經(jīng)過微生物的轉(zhuǎn)化，在富營養(yǎng)化的水中，常常出現(xiàn)亞硝酸鹽和硝酸鹽，長期飲用這種水，人畜會中毒致病。